Оккупация Новгорода продолжалась 29 месяцев. К концу оккупации в городе фактически не осталось целых зданий. Из 2346 жилых домов сохранилось с небольшими разрушениями только 40, частично пригодных для жилья. Согласно обобщённому акту № 1 от 4 марта 1945 г. в городе были разрушены все больницы, школы, библиотеки, музеи, все промышленные предприятия, водопровод, электростанции и другие сооружения городского хозяйства. Сожжённое здание музея было превращено в солдатские казармы. Значительное число оставшихся сооружений было минировано. Вернувшиеся в город новгородцы жили в землянках, расчищали руины, восстанавливали разрушенное хозяйство. Уже в 1945 году знаменитый архитектор А. В. Щусев разработал генеральный план восстановления Новгорода. При восстановлении города были сохранены историческая архитектурно-пространственная композиция Новгорода, его неповторимый силуэт. Храмы и монастыри получили статус памятников мировой культуры, подлежащих безусловному восстановлению.

В Новгороде и окрестностях были разрушены, повреждены или уничтожены величайшие памятники древнего русского искусства: Георгиевский собор Юрьева монастыря, Софийский собор, Церковь Успенья на Волотовом поле, церковь Спаса Преображения на Ильине улице, церковь Спаса-Нередицы и другие. Пострадали древние башни Кремл и здания, относящиеся к XV-XVII векам. Здесь были размещены казармы, солдатские клубы, оружейные мастерские, склады и т.п. По приказу командующего 18 германской армии, генерал-полковника Линдемана, был разобран и подготовлен для отправки в Германию памятник 1000-летия России. С созданием научно-реставрационной производственной мастерской в мае 1945 года началось восстановление архитектурных памятников Новгорода. Первые реставраторы, работавшие в мастерской, были истинными подвижниками, трудом которых возвращены многие разрушенные шедевры новгородской архитектуры. Возрождённые памятники Новгорода и его окрестностей, имеющие выдающуюся универсальную ценность, в 1992 году включены в список объектов Всемирного наследия ЮНЕСКО.